“法輪功”利用公共治理模式轉型的空檔。公共治理是包括政府行政管理和公共部門管理在內的新的管理范式，是政府不斷走向規(guī)范化、服務型的必要過程。
改革開放以來，我國政府一直致力于從管理型向服務型的轉變，努力形成政府服務于社會的格局，實現了諸如國家機構組織、職能、工作程序的法定化，公務人員管理制度化，公共服務市場化等一系列改革，提高了公共物品和公共服務供給的效率。
但在公共治理模式轉型期間，由于基礎薄弱又面臨著國際國內的復雜形勢，政府的主要精力集中于經濟建設和市場發(fā)展，以滿足物質生活的需求，卻沒有很好地滿足群眾的精神文化需求，對邪教組織的活動也缺乏必要的監(jiān)管。一時間各種特異功能紛紛出現，氣功大師不斷“出山”。而“法輪功”邪教組織也就是在這段時間，針對群眾對氣功商品化的不滿，以免費學功為誘餌，乘機發(fā)展組織，擴大影響。部分群眾由于被其混雜佛、道的理論和漫天吹噓的謊言蒙騙，成了其組織的一員。
“法輪功”組織活動是對政府公共治理的逆動。“法輪功”組織用歪理邪說對成員進行精神控制，四處進行非法宣傳，以升天圓滿為誘餌鼓動他們參與非法活動，妄圖對抗政府的處理，極大的影響了公共治理的進行。
“法輪功”蠱惑群眾，動搖公共治理的思想基礎。
公共治理強調群眾和社會團體參與對社會的管理，并應成為主要力量。故人民群眾的思想意識狀態(tài)直接關系著公共治理的效果和成敗。而“法輪功”邪教組織用歪理邪說蠱惑群眾，混淆群眾思想意識，嚴重動搖了公共治理的思想基礎：
公然沖擊社會的法制意識。如號稱“天法”大于“人法”，以修煉為名拒絕服從我國的法律制度；宣稱法律是國家領導人的個人意愿，從根本上質疑法律的權威；對憲法和法律斷章取義、生吞活剝，攻擊政府處理邪教的合法性。
肆意破壞社會的道德觀念。如顛覆傳統(tǒng)道德觀念，用“真、善、忍”混淆“真、善、美”，并稱為宇宙特性；扭曲道德行為，把助人為樂歪曲為“德”“業(yè)”交易。
瘋狂破壞社會的科學精神。如認為科學是人類自己劃定的愚見框框；號稱所有的科學成果都是外星人操作的結果；認定“法輪功”是超常的科學。
“法輪功”頻繁活動，破壞公共治理的有序開展。
隨著“法輪功”邪教本性的不斷顯現，特別在具有一定的動員成員的能力后，它對公共治理就成為了一種顛覆性的沖擊力量，極大地影響了政府公共治理的正常運作，占用了大量的社會管理資源，增加了社會管理的成本。如在“4·25”事件以前，為了爭得所謂“練功空間”和“名譽”，組織了百余起圍攻黨政機關、新聞出版單位的非法聚集。為實現李洪志的個人野心，竟安排數萬人圍攻黨中央、國務院所在地中南海，將普通練習者推到反社會的第一線，甚至希望“流點血”。為了對抗國家的處理，賣身投靠國際反華勢力，瘋狂抹黑祖國，極盡破壞之能事。他們盜取黨和國家機密，非法收集國家的重要情報，出賣給外國，危害了國家安全。編造謊言，開展所謂的全球公訴運動，對從事反邪教的同志進行濫訴，妨礙了正常公務。干擾通訊衛(wèi)星，進行電視插播，破壞正常信息通訊、傳播，進行非法集會、串聯，“發(fā)正念”、“滅邪惡”，影響了正常社會秩序。掛小喇叭宣傳“法輪功”的歪理邪說，貼小廣告、打IP電話晝夜騷擾、發(fā)垃圾郵件不?！稗Z炸”，浪費了寶貴的社會資源。
“法輪功”煽動對抗，影響公共治理的效能發(fā)揮。
當今中國社會正處于經濟發(fā)展、社會進步的歷史機遇期，也是各種社會利益訴求沖突的關鍵期，如何促進國家穩(wěn)定和快速發(fā)展已經是政府必須面對的重要課題，公共治理的任務十分繁重。在這樣一個關鍵的時期，“法輪功”卻大肆制造謊言挑起各種社會矛盾，制造社會影響，干擾政府正常工作，遲滯規(guī)范化、服務型政府的推進過程，影響了公共治理的發(fā)展和運行。如明慧網、大紀元時報等編造千萬人退黨、退團、退隊等。離間群眾與黨和政府的關系，插手各種社會事件進行歪曲，挑起群眾團體之間的沖突和對抗，挑戰(zhàn)和削弱政府控制社會局面的能力，妄圖產生新的“顏色革命”，以推翻國家政權。
鏟除邪教活動是完善公共治理的重要內容。推動公共治理的制度不斷完善是建設“和諧社會”的重要部分，反對邪教也是完善公共治理制度題中應有之意。在應對“法輪功”等邪教組織對公共治理的沖擊中，需要社會各界和政府共同努力。
為此地，應加快規(guī)范化、服務型政府建設。認真實踐“執(zhí)政為民”的理念，堅持以人為本，不斷明晰公共管理和公共服務的力量配置，保證提供高效、優(yōu)質的公共服務，不斷強化非營利公共事業(yè)的發(fā)展，進一步密切政府與人民群眾的血肉聯系，減少群體性事件，從源頭上消除“法輪功”邪教煽動對抗的能力。
促進有條件和有能力的社會團體參與社會事務的策劃、參謀及管理，拓寬群眾表達和實現利益訴求的合法管道，多方面多途徑化解社會矛盾。在群眾和社會團體參與公共治理的過程中，堅持納入反邪教內容，形成反邪教的社會網絡。
加強對廣大人民群眾的反邪教教育。公共治理過程中應增強群眾辯識邪教、抵御邪教歪理邪說的免疫力，反制“法輪功”的非法宣傳。開展各種健康向上的文化、體育活動，倡導科學、文明的生活方式，普及科學知識，提高全民的科學精神，形成反邪教的社會氛圍。